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ITA
La rete delle malattie umane è probabilmente l’immagine più riprodotta del mio laboratorio. È stata originariamente pubblicata come figura in un documento scientifico.
Successivamente è stata riprodotta dal New York Times ed esposta alla Serpentine Galleries di Londra. Le sue radici risalgono al 2001 e alla conclusione del Progetto Genoma Umano e negli anni successivi, quasi ogni settimana, un altro gene veniva collegato a un’altra malattia.
Ho trascorso l’anno accademico 2005-2006 al Dana-Farber Cancer Institute dell’Università di Harvard. In quell’ambiente ho iniziato a pensare a come concettualizzare questi numerosi collegamenti tra malattie e geni. I nodi corrispondono a diverse malattie, i colori riflettono la classe della malattia. Il blu è il cancro. I nodi rossi sono le malattie neurologiche e due malattie sono collegate tra loro se lo stesso gene può causarle entrambe. Ovvero, se le due malattie hanno le stesse radici genetiche.
Attraverso questa mappa, ho capito per la prima volta che malattie completamente diverse, per le quali non solo ci rivolgiamo a medici diversi, ma andiamo in ospedali diversi per essere curati, sono tutte collegate a livello genetico e cellulare. È stato in questa mappa delle malattie che abbiamo iniziato a codificare le informazioni nella dimensione dei nodi.
Dovevamo riflettere il fatto che alcune malattie hanno più geni associati, mentre altre ne hanno solo uno o due. Così abbiamo finito per cambiare la dimensione del nodo per riflettere il numero di geni associati. La sordità è il nodo più grande di questa mappa perché all’epoca vi erano associati circa 34 geni diversi.
Questi cambiamenti nelle dimensioni dei nodi sono diventati oggi una componente comune della visualizzazione delle reti. Questi cambiamenti nelle dimensioni dei nodi sono diventati oggi un elemento comune del vocabolario visivo della rappresentazione delle reti.
ENG
The Human Disease Network is probably the most reproduced image coming out from my lab. It was originally published as a figure in a scientific paper.
It was subsequently reproduced by the New York Times and exhibited by the Serpentine Galleries in London. Its roots go back to 2001 and the finishing of the Human Genome Project and in the subsequent years, almost weekly, another gene was connected to yet another disease.
I spent the academic year, 2005 2006 at Dana-Farber Cancer Institute at Harvard University. And in that environment, I started to think about how do we conceptualize this many links between diseases and genes.
The nodes corresponds to different diseases, colors reflecting the class of disease. Blue are cancer. Red nodes are neurological diseases, and two diseases are linked together If the same gene can cause both of them. That is, if the two diseases have the same genetic roots.
Through this map, I first understood that completely different diseases for which not only we see different doctors, but we go to different hospitals to be treated, are all connected at the genetic and the cellular level. It was in this disease map that we first started to encode information in the size of the nodes.
We needed to reflect the fact that some diseases have multiple genes associated with them, others have only one or two. So we ended up changing the size of the node to reflect the number of genes associated with them. The deafness is the biggest node in this map because at that time about 34 different genes were associated with it.
This changes in the node sizes became today a common component of network visualization. These changes in node sizes became now a common element of the visual vocabulary of network representation.
